Po wydarzeniach z filmu Alex, Gloria, Melman i Marty zostają w Afryce. Natomiast paczka pingwinów wraca do Central Parku, gdzie czeka na nich nowa misja – objąć kontrolę nad zoo. Misja komplikuje się, gdy pingwiny odkrywają, że zabrał się z nimi pasażer na gapę – Król Julian i jego banda lemurów
Postacie

* Skipper – lider grupy pingwinów. Obmyśla taktykę, wydaje rozkazy oraz bardzo często nadaje swoim planom chwytliwe nazwy (np. operacja: "uciszyć mazgaja bo więdną uszy"). Kocha sushi. Ma awersję do igieł[1]. W jednym z późniejszych odcinków dowiadujemy się, że być może jest dziewczyną lecz okazuje się to tylko plotką. Ma pewne porachunki z Duńczykami lecz jest to wielka tajemnica.
* Szeregowy (oryg. Private) – najmłodszy z grupy pingwinów. Zawsze chętny do zadań. Robi bardzo dobre koktajle. Jest bardzo wrażliwy, potrafi rozszyfrować przeróżne zadania. Czasami to właśnie on myśli najrozsądniej.
* Kowalski – strateg pingwinich komandosów, który podaje również sugestie (chociaż w sprawach sercowych sugestie podaje Szeregowy). Jest bardzo inteligentny, ale ma tendencję do przesadnego analizowania sytuacji[2]. Boi się dentysty (co dziwne gdyż pingwiny nie mają zębów). Jest zakochany w delfinicy Doris, niestety bez wzajemności. Najmądrzejszy z pingwinów.
* Rico – pingwin, specjalista od zadań wybuchowych. Uwielbia strzelać i wysadzać. Potrafi połknąć, a następnie wypluć praktycznie wszystko, np. latarkę, dynamit czy młotek. Prawie nigdy nic nie mówi, częściej wydaje dźwięki przypominające ochrypłe chrząkanie.

Pingwiny na swoim wybiegu mają podziemną bazę. Wejście do niej znajduje się pod miską na jedzenie. W swej siedzibie mają telewizor, lodówkę i inne rzeczy, których lemury im zazdroszczą. Jest tam też łazienka, pracownia Kowalskiego itd.

* Król Julian – lemur, uważający się za króla całego zoo. Jest samolubny i wierzy w pradawnych bogów. Nie znosi, gdy ktoś dotyka jego stóp. Żyje w przekonaniu, że wszyscy go lubią.
* Maurice – lemur. Prawa ręka Juliana oraz jego "wafel".
* Mort – lemur. Niezmordowany wielbiciel Króla Juliana. Słodki, choć nieporadny. Robi wszystko, co mu król Julian rozkaże. Ma słabość do stóp Juliana. W odcinku "Dwie stopy nad ziemią i wyżej" przystępuje na jakiś czas do pingwinów.
* Marlenka (ang. Marlene) – wydra z zoo. Przyjaciółka pingwinów. Z każdym próbuje się zaprzyjaźnić przez co Skipper uważa ją za tak samo naiwną jak Manfreddie i Joseph. Natomiast ona uważa, że szef pingwinów ma paranoję, bo w wielu osobach widzi wroga.



Odcinki są dziwnie ponumerowane, ale proszę być pewnym iż ściągając wszystkie, obejrzysz całe 51 odcinków